Espèce de plante dicotylédone. La plantule issue de la germination d’une graine, présente dès avant sa sortie en plein air, deux feuilles, appelées cotylédons ou parfois improprement, préfeuilles ou éophylles.

Ipomoea trifida est une plante herbacée annuelle, grimpante, volubile, aux tiges ramifiées, glabre ou poilue. Les feuilles, de 2,4 à 9,5 cm de long sur 2 à 5,7 cm de large, sont ovales, subtrilobées ou trilobées, à sommet obtus à acuminé. L’ inflorescence regroupe de 1 à 9 (15) fleurs. Le calice a des sépales inégaux, de 7 à 10 mm de long, elliptiques ou étroitement elliptiques, apiculés, scarieux, souvent ciliés, glabres ou poilus. Les sépales extérieurs étant plus courts que les intérieurs. La corolle infundibuliforme, de 2,2 à 3,8 cm de long, est de couleur lilas à violet, avec le tube plus pâle à l’extérieur. Le fruit est une capsule subglobuleuse, biloculaire, de 4 à 6 mm de haut, renfermant 4 graines. celles-ci, de 3 à 4 mm de long, sont subglobuleuses ou triquètres, glabres, brillantes.
Le système racinaire est constitué d’une racine pivotante, ramifiée, charnue.